《孤狼之血》的故事背景为1988年施行《黑社会对策法》之前的广岛。被派到当地警署的日冈秀一，与传闻中跟黑社会有勾结的刑警大上章吾一起，负责调查金融公司员工失踪案。日冈因为大上异于常人的调查手段困惑不已

该片讲述前作三年后的故事，治理广岛架空都市吴原市黑社会的传说中的刑警大上章吾去世之后，年轻的主人公日冈继承他的遗志，继续为一方和平努力的故事。